Una de les seves principals passions són els manuscrits il·luminats, els llibres antics i documents anteriors a la invenció de la impremta (Gutenberg 1454). La majoria d’aquestes obres procedeix de pergamins antics disseminats per biblioteques al llarg del món. Altres llibres van ser copiats durant segles per monjos dedicats a la recuperació d’obres clàssiques, àrabs i medievals, il·luminats de forma artística per aquests monjos amb il·lustracions banyades en ocasions en or i altres metalls. Per satisfer aquesta passió bibliòfila, i la d’altres com ell, Miquel Huguet ha impulsat el projecte La Biblioteca Impossible, el segell editorial fundat per a la reproducció de documents i manuscrits en reproducció facsímil, i que actualment té com a edicions fonamentals els llibres Andorra Aeterna o Cathalonia Aeterna.
Huguet ha fet de la seva bibliofília un negoci, per la qual cosa progressivament ha anat abandonant la seva activitat professional en l’àmbit de “les molècules” per dedicar-se a “la seva passió”, que són els manuscrits il·luminats, i els documents anteriors a Gutenberg (1.454). Col·leccionista empedreït, posseeix una àmplia i molt exclusiva col·lecció de manuscrits il·luminats.